RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 SHPKQ9UHJ6 478 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 GPR132Q9UNW8 380 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 MFNGO00587 321 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ABCD4O14678 606 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SOCS1O15524 211 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ATG12O94817 140 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 IL32P24001 234 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 FPR2P25090 351 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 DOK3Q7L591 496 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR6X1Q8NH79 312 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OCSTAMPQ9BR26 566 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 METTL7AQ9H8H3 244 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 FAM74A7A6NL05 159 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TRIOO75962 3097 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SFT2D2O95562 160 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PLATP00750 562 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SLC2A1P11166 492 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CDAP32320 146 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 KCNMB1Q16558 191 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PDSS1Q5T2R2 415 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR5H2Q8NGV7 314 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM230Q96A57 120 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM100Q9NV29 134 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 NUDT19A8MXV4 375 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 MYF5P13349 255 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF17P17021 662 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PTGDSP41222 190 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 NPY4RP50391 375 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 MFAP5Q13361 173 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 BAP18Q8IXM2 172 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A45Q8N413 288 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 GPER1Q99527 375 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 RNF126Q9BV68 326 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 BANF2Q9H503 90 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM218A2RU14 115 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 RAD51DO75771 328 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 GRB2P62993 217 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CARD17Q5XLA6 110 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 RNF141Q8WVD5 230 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ARL11Q969Q4 196 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR5B2Q96R09 309 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SOX7Q9BT81 388 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF319Q9P2F9 582 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 RER1O15258 196 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 KCNAB3O43448 404 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 LYL1P12980 280 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ICAM2P13598 275 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 AMY2BP19961 511 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM50BP56557 158 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SGCAQ16586 387 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 HIST3H3Q16695 136 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CLEC18BQ6UXF7 455 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SVBPQ8N300 66 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR10G3Q8NGC4 313 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OXGR1Q96P68 337 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CA14Q9ULX7 337 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TAS2R46P59540 309 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ACY1Q03154 408 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ARFRP1Q13795 201 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PRSS54Q6PEW0 395 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TMPPEQ6ZT21 453 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 FAM57BQ71RH2 274 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 LHFPL1Q86WI0 220 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR10A2Q9H208 303 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 MYOTQ9UBF9 498 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 LAMA1P25391 3075 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PNR3 127 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ZFAND5O76080 213 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms