RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MED30Q96HR3 178 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CCL13Q99616 98 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 USP34Q70CQ2 3546 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PRX2 142 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 INAFM1C9JVW0 142 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SH2D1BO14796 132 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 AHCYL1O43865 530 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 WISP2O76076 250 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CD80P33681 288 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR3A4PP47883 348 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH3A2P51648 485 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RPL11P62913 178 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GABRA6Q16445 453 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM65Q6PI78 240 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RFESDQ8TAC1 157 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ASB17Q8WXJ9 295 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TMED9Q9BVK6 235 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 BCO1Q9HAY6 547 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GPR84Q9NQS5 396 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf4Q9NR00 106 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MIOXQ9UGB7 285 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF221Q9UK13 617 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF292O60281 2723 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 M0R129 80 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 WRBO00258 174 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SNAP29O95721 258 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-13P01766 116 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-7P01780 117 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CEACAM3P40198 252 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GNG2P59768 71 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MXD1Q05195 221 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK11Q15759 364 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GRK1Q15835 563 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LHX4Q969G2 390 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C7orf34Q96L11 122 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FAM210AQ96ND0 272 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR2H1Q9GZK4 316 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TOR3AQ9H497 397 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF879B4DU55 563 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 B4DXG7 233 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ARL6IP5O75915 188 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 YIF1AO95070 293 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TNFAIP8O95379 198 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ONECUT2O95948 504 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GYPAP02724 150 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NR4A1P22736 598 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CRYBA2P53672 197 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DRAM2Q6UX65 266 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 UFD1Q92890 307 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FGGYQ96C11 551 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR2M2Q96R28 347 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 IL19Q9UHD0 177 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 hADV38S2A0JD32 116 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TFP02787 698 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 IFI6P09912 130 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CTLA4P16410 223 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RBP2P50120 134 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DLX5P56178 289 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ACTG2P63267 376 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LINGO2Q7L985 606 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01356Q8N9X3 169 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms