RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CAPZA1P52907 286 aa15.59■□□□□ 0.09
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ACTB-201ENST00000331789 FAAP20Q6NZ36 180 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 SSC4DQ8WTU2 575 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
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ACTB-201ENST00000331789 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF175Q9Y473 711 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 LOC100509620A0A075B734 347 aa15.56■□□□□ 0.08
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ACTB-201ENST00000331789 H2AFB2P0C5Z0 115 aa15.56■□□□□ 0.08
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ACTB-201ENST00000331789 TRIB1Q96RU8 372 aa15.55■□□□□ 0.08
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ACTB-201ENST00000331789 AKAP13Q12802 2813 aa15.55■□□□□ 0.08
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ACTB-201ENST00000331789 MPIG6BO95866 241 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 CCL2P13500 99 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 GTF2F2P13984 249 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 CD83Q01151 205 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 ZNF260Q3ZCT1 412 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 OR2W3Q7Z3T1 314 aa15.55■□□□□ 0.08
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