RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 HAO2Q9NYQ3 351 aa17.98■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 GHRLQ9UBU3 117 aa17.98■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 LIPT2A6NK58 231 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 OGG1O15527 345 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 HPNP05981 417 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 PSMB10P40306 273 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 SIRPAP78324 504 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 HYAL4Q2M3T9 481 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 NAA40Q86UY6 237 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 SLC43A2Q8N370 569 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 KCNRGQ8N5I3 272 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC75AQ8NAA5 344 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 OR4C16Q8NGL9 310 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF417Q8TAU3 575 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 GFI1Q99684 422 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 CHST6Q9GZX3 395 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM231Q9H6L2 316 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 TREM1Q9NP99 234 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 GNG8Q9UK08 70 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 BCL2L11O43521 198 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ACTL6AO96019 429 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 RD3LP0DJH9 198 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 SRMP19623 302 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 FAUP35544 74 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 RPL4P36578 427 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 TMPRSS3P57727 454 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 SGCBQ16585 318 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 IGFL3Q6UXB1 125 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 SKA3Q8IX90 412 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 MNTQ99583 582 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV17A0A0B4J275 112 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 TXNL1O43396 289 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 SPI1P17947 270 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R20P59543 309 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ALG10Q5BKT4 473 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 SNX33Q8WV41 574 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 C5orf52A6NGY3 159 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 K7EM74 188 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 EDNRAP25101 427 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEB1P43366 347 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 GFRA1P56159 465 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 RAC1P63000 192 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 PMP22Q01453 160 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 RNFT1Q5M7Z0 435 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 KRT77Q7Z794 578 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ZADH2Q8N4Q0 377 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ALKBH4Q9NXW9 302 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-201ENST00000265339 ACOD1A6NK06 481 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 IFNGP01579 166 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 F13BP05160 661 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SSTP61278 116 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 POU4F2Q12837 409 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PEA15Q15121 130 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2CO00762 179 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PLPP3O14495 311 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 CAPZA1P52907 286 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 UCNP55089 124 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 TBR1Q16650 682 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ZNRF4Q8WWF5 429 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PHYHIPLQ96FC7 376 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 EXO5Q9H790 373 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR5V1Q9UGF6 321 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR5H14A6NHG9 310 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF879B4DU55 563 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 WRBO00258 174 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 RBBP9O75884 186 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 DIO1P49895 249 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf91Q5T1B1 145 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 GLB1L2Q8IW92 636 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35F2Q8IXU6 374 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR51S1Q8NGJ8 323 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 MIB2Q96AX9 1013 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf196B1AJZ1 125 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 C11orf98E9PRG8 122 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PSMD9O00233 223 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 IMPA2O14732 288 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ABOP16442 354 aa17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms