RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-201	ENST00000262291	CXCL2	P19875	107 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF627	Q7L945	461 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	LAMA5	O15230	3695 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	C21orf140	B9A014	251 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	DHH	O43323	396 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	HTR2C	P28335	458 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	RAC3	P60763	192 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	CRLF2	Q9HC73	371 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291		A0A1B0GTI1	187 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	MSR1	P21757	451 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM54	Q969K7	222 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	MLX	Q9UH92	298 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291		A0A1B0GVI7	797 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GJE1	A6NN92	205 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	B4GALT1	P15291	398 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	BVES	Q8NE79	360 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	CMBL	Q96DG6	245 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	LRRC46	Q96FV0	321 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GABARAP	H6UMI1	98 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ISG15	P05161	165 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GSG1	Q2KHT4	349 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	OR8S1	Q8NH09	359 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ETV7	Q9Y603	341 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GGT3P	A6NGU5	568 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291		L7N2F9	121 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	CASR	P41180	1078 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	NELFA	Q9H3P2	528 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	NKX2-8	O15522	239 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF20	P17024	532 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	GFRA1	P56159	465 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	FAM166A	Q6J272	317 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291		Q6ZTK2	550 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	PGAM5	Q96HS1	289 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	ADGRG7	Q96K78	797 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	COA4	Q9NYJ1	87 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VMP1-201	ENST00000262291	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5

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