RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TVP23AA6NH52 213 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YC42 278 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DCTN6O00399 190 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA2O43678 99 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 RLN2P04090 185 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-GP17693 338 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 HSF1Q00613 529 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCA2AQ02747 115 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF679Q8IYX0 411 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP19Q8WTR2 217 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SEH1LQ96EE3 360 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 GNRHR2Q96P88 292 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 COMMD9Q9P000 198 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SCDO00767 359 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF264O43296 627 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CD74P04233 296 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXK1P85037 733 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ROM1Q03395 351 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 MEF2DQ14814 521 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 LY6G6FQ5SQ64 297 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51A4Q8NGJ6 313 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10K1Q8NGX5 313 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10AC1Q8NH08 325 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF416Q9BWM5 594 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 KLRF1Q9NZS2 232 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX46H3BTG2 121 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DOK2O60496 412 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 F13BP05160 661 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA5P43359 124 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 STARP49675 285 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC18B1Q6NT16 456 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CLRN3Q8NCR9 226 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 STEAP2Q8NFT2 490 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB127Q9H1M4 99 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 XKRYO14609 159 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL2L11O43521 198 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 FADS1O60427 444 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 MPZP25189 248 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIAP62937 165 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PLGLB1Q02325 96 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 EGR4Q05215 589 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ETFDHQ16134 617 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM251Q8N6I4 163 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXW5Q969U6 566 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A28Q96A46 364 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOVL3Q9HB03 270 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF18Q9UNG2 199 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DHDHQ9UQ10 334 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GTH9 108 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5H14A6NHG9 310 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 UTS2O95399 124 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CYB5AP00167 134 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 APOC3P02656 99 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH3Q86UD3 253 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PM20D2Q8IYS1 436 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF138Q8WVD3 245 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DMRTA2Q96SC8 542 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM19Q9H013 955 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGMQ9H3S5 423 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A8Q9NY64 477 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYABP02511 175 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR2CP28335 458 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM225Q6GV28 225 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 WDSUB1Q8N9V3 476 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1J4Q8NGS1 313 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST6Q9GZX3 395 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 LIPGQ9Y5X9 500 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DISC1C4P0D8 188 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM4BO94953 1096 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 GNLYP22749 145 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf87Q6NUJ2 197 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 LRFN4Q6PJG9 635 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8S1Q8NH09 359 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRT1Q99946 306 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 LAT2Q9GZY6 243 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT4Q9H2B2 425 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R3Q9NYW6 316 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-ATP6P00846 226 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CD34P28906 385 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 BIVMQ86UB2 503 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 GATSQ8NAP1 163 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB19A4D1S5 217 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 AMY2AP04746 511 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 MEP1BQ16820 701 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms