RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 THBS4P35443 961 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 NCR3LG1Q68D85 454 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 DEGS1O15121 323 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 MBTPS2O43462 519 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 CXCL10P02778 98 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 DTYMKP23919 212 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 RNF4P78317 190 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF75AQ96N20 296 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 AMER3Q8N944 861 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 OR6C1Q96RD1 312 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 MPPED1O15442 326 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 CD160O95971 181 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 NRASP01111 189 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 MOGAT2Q3SYC2 334 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 TRILQ7L0X0 811 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 FAM58AQ8N1B3 248 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 NINQ8N4C6 2090 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 H0Y8X5 98 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 OR8U8P0C7N1 319 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 FGF7P21781 194 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 AKR1C3P42330 323 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 PHYHD1Q5SRE7 291 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 LHX8Q68G74 356 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 SLC35B3Q9H1N7 401 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 NTMQ9P121 344 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 EXT1Q16394 746 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 BTNL8Q6UX41 500 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 PATE1Q8WXA2 126 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 GPR31O00270 319 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 RD3LP0DJH9 198 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 SCGB2A2Q13296 93 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 FZD2Q14332 565 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 UQCC1Q9NVA1 299 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 SPINT2O43291 252 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 TBXA2RP21731 343 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 OR4F5Q8NH21 305 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 CHAC2Q8WUX2 184 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 OR4F4Q96R69 305 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA13-201ENST00000222753 PHOX2AO14813 284 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 IFITM2Q01629 132 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PARM1Q6UWI2 310 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 DBX2Q6ZNG2 339 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.71■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 STRCQ7RTU9 1775 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SPANXN5Q5MJ07 72 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM91Q6ZNR0 172 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 C4orf47A7E2U8 309 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SMIM6P0DI80 62 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 COX5AP20674 150 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PAX6P26367 422 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 NKAIN2Q5VXU1 208 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SYT13Q7L8C5 426 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CBY1Q9Y3M2 126 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 TMED3Q9Y3Q3 217 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CER1O95813 267 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 C4orf17Q53FE4 359 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF429Q86V71 674 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OR10P1Q8NGE3 313 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF586Q9NXT0 402 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CD27P26842 260 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CAPZBP47756 277 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 GABRA2P47869 451 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ELSPBP1Q96BH3 223 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PLGLAQ15195 96 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 LYPD8Q6UX82 237 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 C11orf40Q8WZ69 217 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OIT3Q8WWZ8 545 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SEC11CQ9BY50 192 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms