RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC119BA6NIH7 251 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 NPFFO15130 113 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTA4O15217 222 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT34O76011 436 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNDC12O95881 172 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF92Q03936 586 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MZT1Q08AG7 82 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6V1Q8N148 313 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SPERTQ8NA61 448 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5R1Q8NH85 324 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTSSAQ969W0 71 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL13Q99616 98 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGLEC9Q9Y336 463 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GW55 424 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 EDF1O60869 148 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 H1F0P07305 194 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX4L2P0CJ85 424 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF10Q13118 480 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KLRD1Q13241 179 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 NMNAT3Q96T66 252 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf119Q9NWQ9 140 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KAAG1Q9UBP8 84 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX4Q9UBX2 424 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCR6O00574 342 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FXYD6P3P58550 94 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MICBQ29980 383 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 RFX4Q33E94 735 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAI3Q3KNW1 292 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX36Q5VZQ5 186 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCD3Q6STE5 483 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FBLN5Q9UBX5 448 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ENPP4Q9Y6X5 453 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MEIOCA2RUB1 952 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINA1P01009 418 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 OMPP47874 163 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DLX1P56177 255 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 IKZF1Q13422 519 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CBLL1Q75N03 491 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM216BQ8N7L0 139 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 OR56B2PQ8NGI1 322 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8S1Q8NH09 359 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4K13Q8NH42 304 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FANK1Q8TC84 345 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC29Q8WV35 223 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FN3KQ9H479 309 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TOR3AQ9H497 397 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MRGBPQ9NV56 204 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXJ3Q9UPW0 622 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 BHLHE40O14503 412 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR37O15354 613 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 GRK5P34947 590 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PCK2Q16822 640 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR38Q5JTN6 314 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 GLYATL3Q5SZD4 288 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PNKDQ8N490 385 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CMTM6Q9NX76 183 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ADA2Q9NZK5 511 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFB3O43676 98 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SAA4P35542 130 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LY6G5BQ8NDX9 201 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4C13Q8NGP0 309 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R14AQ96A00 147 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 AP3M1Q9Y2T2 418 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRQ8 180 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LHBP01229 141 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF823P16415 610 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 NOS3P29474 1203 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A6P31641 620 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LOXL3P58215 753 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LIPEQ05469 1076 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.189e-8■■■■■ 39.8
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