RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 CTLA4P16410 223 aa8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 GDI1P31150 447 aa8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 ISOC2Q96AB3 205 aa8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 FBXL17Q9UF56 701 aa8.79□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WWC5 75 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 IFNA10P01566 189 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 IFNA6P05013 189 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 SPARCP09486 303 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 CEACAM6P40199 344 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 MMP16P51512 607 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 OR2A2Q6IF42 318 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 C5orf34Q96MH7 638 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 RGCCQ9H4X1 137 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 DECR2Q9NUI1 292 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 MEMO1Q9Y316 297 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 SLC6A8P48029 635 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 MIDNQ504T8 468 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 CBLN3Q6UW01 205 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 FAM219AQ8IW50 185 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 OR8G5Q8NG78 346 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 SPSB2Q99619 263 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 OR10A5Q9H207 317 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 RAD51DO75771 328 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 FCARP24071 287 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 CXCR1P25024 350 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 SLC26A5P58743 744 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 TDGQ13569 410 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 ACKR1Q16570 336 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 GAL3ST1Q99999 423 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 TBX21Q9UL17 535 aa8.77□□□□□ -1
HCG18-242ENST00000602319 A0A0J9YY10 115 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 XKRYO14609 159 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 IFNA2P01563 188 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 REC114Q7Z4M0 266 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 S100A13Q99584 98 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 RBP2P50120 134 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 CLDN6P56747 220 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 FOXK1P85037 733 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 ZP2Q05996 745 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 CLINT1Q14677 625 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 PFDN5Q99471 154 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 NICN1Q9BSH3 213 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 RAB33BQ9H082 229 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 BCO1Q9HAY6 547 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.77□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PPE2 198 aa8.76□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 ZNF724A8MTY0 619 aa8.76□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 UMAD1C9J7I0 102 aa8.76□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 SLC16A7O60669 478 aa8.76□□□□□ -1.01
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