RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 FDX2Q6P4F2 183 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 OR52H1Q8NGJ2 320 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC7A6Q92536 515 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ACOXLQ9NUZ1 547 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCD4O14678 606 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SOD3P08294 240 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 DANCRP0C864 163 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CALCRP30988 508 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CDKN1AP38936 164 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TGM4P49221 684 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS23P62266 143 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 BDH1Q02338 343 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF485Q8NCK3 441 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP37Q8NFH4 326 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5L1Q8NGL2 311 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 FCGR1BQ92637 280 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PELI1Q96FA3 418 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM206AQ9NX38 181 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 BABAM2Q9NXR7 383 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF115Q9Y4L5 304 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TGP01266 2768 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 H3BSA7 217 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL2P13500 99 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 NR4A1P22736 598 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT5AP41221 380 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ACSM1Q08AH1 577 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SPARTQ8N0X7 666 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ITFG2Q969R8 447 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 OPA3Q9H6K4 179 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PRR14LQ5THK1 2151 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A096LNT2 108 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LCATP04180 440 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SRD5A1P18405 259 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 CCR9P51686 369 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 UCP2P55851 309 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SPHARQ15513 63 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2G6Q5TZ20 316 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC22A25Q6T423 547 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF367Q7RTV3 350 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS45Q7RTY3 260 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RORBQ92753 470 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXW5Q969U6 566 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 OR10A2Q9H208 303 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RGCCQ9H4X1 137 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ISYNA1Q9NPH2 558 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 XRCC2O43543 280 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RPP14O95059 124 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH15P55291 814 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 HGFACQ04756 655 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 MALLQ13021 153 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 CATSPERDQ86XM0 798 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PGAM5Q96HS1 289 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 OR52A1Q9UKL2 312 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 TENM1Q9UKZ4 2725 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 VSTM5A8MXK1 200 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFS7O75251 213 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 CFL1P23528 166 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 GLRXP35754 106 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 KLBQ86Z14 1044 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ABHD4Q8TB40 342 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 GATAD2BQ8WXI9 593 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PBOV1Q9GZY1 135 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF442Q9H7R0 627 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A0U1RQV5 110 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PNPP00491 289 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1CBP62140 327 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SPOCK1Q08629 439 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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