RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592275.5

USP36-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 4

Gene USP36, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-222	ENST00000592275	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	LHX4	Q969G2	390 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	PKP2	Q99959	881 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	DUX4	Q9UBX2	424 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	DVL1	O14640	695 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	NDUFA2	O43678	99 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	OR10H3	O60404	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	GYPA	P02724	150 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	TPTE	P56180	551 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	TAF9	Q16594	264 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	OR52J3	Q8NH60	311 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	C16orf95	Q9H693	158 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-222	ENST00000592275	OR8B8	Q15620	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	PCK2	Q16822	640 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	IFT27	Q9BW83	186 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	KPTN	Q9Y664	436 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	IDH3B	O43837	385 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	AMY2B	P19961	511 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	PYCR1	P32322	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	NUDT2	P50583	147 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	ARF6	P62330	175 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	CDON	Q4KMG0	1287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	DRAM2	Q6UX65	266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	SPTSSA	Q969W0	71 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	GGT3P	A6NGU5	568 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	BHLHE40	O14503	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	NDUFAB1	O14561	156 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	TSPAN9	O75954	239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	GADD45G	O95257	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	NOS3	P29474	1203 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	PSME3	P61289	254 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	SPIB	Q01892	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	POU4F2	Q12837	409 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	WDR38	Q5JTN6	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275		Q8N7P7	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	SPERT	Q8NA61	448 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275		A0A1B0GVI7	797 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	TVP23A	A6NH52	213 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275		A6NLC8	198 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	HLA-DQA2	P01906	255 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	GRP	P07492	148 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	SLC2A1	P11166	492 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	DLX1	P56177	255 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	TSPAN31	Q12999	210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	KLHL12	Q53G59	568 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP36-222	ENST00000592275	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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