RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	GPR84	Q9NQS5	396 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR2AT4	A6NND4	320 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CCS	O14618	274 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SSX5	O60225	188 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LIPC	P11150	499 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	NAT1	P18440	290 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PRKACB	P22694	351 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	VAMP1	P23763	118 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	HIST3H3	Q16695	136 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	MOB3C	Q70IA8	216 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	NAA40	Q86UY6	237 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	HOGA1	Q86XE5	327 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	FAM25E	A8MYX2	175 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ATP1B3	P54709	279 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SHB	Q15464	509 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR5AS1	Q8N127	324 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TERB2	Q8NHR7	220 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	FBXW5	Q969U6	566 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SPSB2	Q99619	263 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	16.29	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PNR3	127 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	RNF222	A6NCQ9	220 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	AQP7P3	A6NL99	342 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TP53I11	O14683	189 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CDC14B	O60729	498 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	MPIG6B	O95866	241 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ABO	P16442	354 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1C4	P17516	323 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CDA	P32320	146 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CBX5	P45973	191 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CX3CR1	P49238	355 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35A1	P78382	337 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	GPR160	Q9UJ42	338 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA1E	Q15878	2313 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS8	O00214	317 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PMP2	P02689	132 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	HCK	P08631	526 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	QDPR	P09417	244 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	MFAP5	Q13361	173 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	BTN1A1	Q13410	526 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CARD17	Q5XLA6	110 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	FADS6	Q8N9I5	356 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CDC6	Q99741	560 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	NICN1	Q9BSH3	213 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LDAH	Q9H6V9	325 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	GAREM1	Q9H706	876 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	WNT16	Q9UBV4	365 aa		16.28	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	DBX1	A6NMT0	343 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	AVPR2	P30518	371 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD9	Q7L273	389 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM17	Q86X19	198 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	RASL10B	Q96S79	203 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	GHRL	Q9UBU3	117 aa		16.27	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN4	O14817	238 aa		16.27	■□□□□ 0.19
RRN3-205	ENST00000563559	RER1	O15258	196 aa		16.27	■□□□□ 0.19
RRN3-205	ENST00000563559	OPN1LW	P04000	364 aa		16.27	■□□□□ 0.19
RRN3-205	ENST00000563559	CNR1	P21554	472 aa		16.27	■□□□□ 0.19
RRN3-205	ENST00000563559	CTSS	P25774	331 aa		16.27	■□□□□ 0.19
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB6	P28072	239 aa		16.27	■□□□□ 0.19

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