RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPRNQ5BIV9 151 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LPCAT4Q643R3 524 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR56B2PQ8NGI1 322 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR2T27Q8NH04 317 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITLN1Q8WWA0 313 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SGK3Q96BR1 496 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR2V2Q96R30 315 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCLRE1BQ9H816 532 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF391Q9UJN7 358 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CACNG2Q9Y698 323 aa18.79■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTNR1AP48039 350 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRP9P49458 86 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM3AP98173 230 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ENTHD1Q8IYW4 607 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR8B12Q8NGG6 310 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCL17Q92583 94 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIMD4Q96H15 378 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MEGF10Q96KG7 1140 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM206AQ9NX38 181 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF319Q9P2F9 582 aa18.78■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 H0YL77 283 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DLGAP1O14490 977 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD5LO43866 347 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APOL3O95236 402 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GABRB1P18505 474 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GZMKP49863 264 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GFOD2Q3B7J2 385 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 Q71RC1 249 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR10H4Q8NGA5 316 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HPS1Q92902 700 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 Q96MT0 163 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBX5Q99593 518 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APOL4Q9BPW4 351 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MOB1AQ9H8S9 216 aa18.77■□□□□ 0.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 F5H5P2 479 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFNL4K9M1U5 179 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HLA-DPB1P04440 258 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT8P05787 483 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGHV4-31P0DP07 118 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CA6P23280 308 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MMP16P51512 607 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACTC1P68032 377 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACTA1P68133 377 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNCBQ16143 134 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLBQ86Z14 1044 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RHOXF1Q8NHV9 184 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB1CQ92928 201 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNFT2Q96EX2 444 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM106BQ9NUM4 274 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa18.76■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A0U1RQV5 110 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRP5LA4QPB2 252 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GMDSO60547 372 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GSK3AP49840 483 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR8G1Q15617 311 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR8B8Q15620 311 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SSX6Q7RTT6 188 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FTMTQ8N4E7 242 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITFG2Q969R8 447 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TREM2Q9NZC2 230 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WIPI2Q9Y4P8 454 aa18.75■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD200P41217 278 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GATA4P43694 442 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MVKQ03426 396 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTC23Q5W5X9 447 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYB5R2Q6BCY4 276 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPERTQ8NA61 448 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLDND2Q8NHS1 167 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PBOV1Q9GZY1 135 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VCXQ9H320 206 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GCM1Q9NP62 436 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 R4GMQ9 66 aa18.74■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SULT1C4O75897 302 aa18.73■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF91Q05481 1191 aa18.73■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MZT1Q08AG7 82 aa18.73■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AVPI1Q5T686 147 aa18.73■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YIPF7Q8N8F6 280 aa18.73■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYGBQ8WWM9 190 aa18.73■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERGIC1Q969X5 290 aa18.73■□□□□ 0.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NARFLQ9H6Q4 476 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms