RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0R3G1 203 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 AIM2O14862 343 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXH1O75593 365 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV1-46P01743 117 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV3-13P01766 116 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERPINA5P05154 406 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD79AP11912 226 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRPRP30550 384 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAD52P43351 418 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MMP15P51511 669 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNA13Q14344 377 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMU1Q2TAY7 513 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 HFEQ30201 348 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 LIN52Q52LA3 116 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF130Q86XS8 419 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 VRK2Q86Y07 508 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 PARP8Q8N3A8 854 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CADM2Q8N3J6 435 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR52I2Q8NH67 350 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF519Q8TB69 540 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGR3Q8TD06 166 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB1CQ92928 201 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC35B4Q969S0 331 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF21AQ96BD5 680 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TIMD4Q96H15 378 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC115Q96NT0 180 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MMP28Q9H239 520 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 C12orf10Q9HB07 376 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBK1Q9UHD2 729 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 AUP1Q9Y679 476 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 LYSTQ99698 3801 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SRRM5B3KS81 715 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 NGFP01138 241 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD55P08174 381 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 EMX2Q04743 252 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAX8Q06710 450 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAGE5Q13069 117 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAGE6Q13070 117 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 PMS2P3Q13401 168 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPRNQ5BIV9 151 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 C16orf87Q6PH81 154 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 NFE4Q86UQ8 179 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SKA3Q8IX90 412 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR4F5Q8NH21 305 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MGARPQ8TDB4 240 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 UPRTQ96BW1 309 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZIM3Q96PE6 472 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 GHITMQ9H3K2 345 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZFP57Q9NU63 452 aa6.94□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A087WUJ7 227 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 E9PBE3 544 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM178BH3BS89 294 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLPXO76031 633 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 PATE4P0C8F1 98 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCL2P13500 99 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SELLP14151 372 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SELEP16581 610 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTR2AP28223 471 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALDH3A1P30838 453 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERPINB5P36952 375 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDKN2CP42773 168 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 AQP5P55064 265 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 COPZ1P61923 177 aa6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLO1Q04760 184 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms