RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 RHOCP08134 193 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 THRAP10827 490 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CD9P21926 228 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 HTR1DP28221 377 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ARL2P36404 184 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 KDSRQ06136 332 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ERCC8Q13216 396 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 DUPD1Q68J44 220 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 COPS6Q7L5N1 327 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 OR52A5Q9H2C5 316 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TREM1Q9NP99 234 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RGS18Q9NS28 235 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CHMP5Q9NZZ3 219 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 IQCF5A8MTL0 148 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 KLLNB2CW77 178 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 H7C2Y5 167 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ALOX12BO75342 701 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 GCGP01275 180 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 BCHEP06276 602 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 GNRHRP30968 328 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ARR3P36575 388 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 HCCSP53701 268 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SIGLEC14Q08ET2 396 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 XRCC4Q13426 336 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CD300LGQ6UXG3 332 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 FAM92BQ6ZTR7 304 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 C15orf56Q8N910 161 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 OR51A7Q8NH64 312 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PIFOQ8TCI5 191 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CDKL2Q92772 493 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TEAD3Q99594 435 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 NOX3Q9HBY0 568 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CTSFQ9UBX1 484 aa3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 LINC01619G3V211 115 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 H0Y9J4 135 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 RAD1O60671 282 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 SC5DO75845 299 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 CST4P01036 141 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 PTHP01270 115 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 SSTR5P35346 364 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 IRF4Q15306 451 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 TCEAL5Q5H9L2 206 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 RNF175Q8N4F7 328 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 OR6K2Q8NGY2 324 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 OR2T29Q8NH02 315 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 OR10G6Q8NH81 332 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 TMEM234Q8WY98 164 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 TCEAL3Q969E4 200 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 CPB2Q96IY4 423 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 CEP170P1Q96L14 293 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 GABRG3Q99928 467 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 VAPAQ9P0L0 249 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 CFL2Q9Y281 166 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 ACOT9Q9Y305 439 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.46□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 A0A1B0GVX0 72 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 ERICH2A1L162 156 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 PINLYPA6NC86 204 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 UPK1BO75841 260 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 SMC2O95347 1197 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 TTC4O95801 387 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 DNASE1L1P49184 302 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 CCR6P51684 374 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 C2orf54Q08AI8 447 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 IFFO1Q0D2I5 559 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 TNXAQ16473 311 aa3.45□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 TAL2Q16559 108 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms