RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552054.1

TBX3-204, Transcript of T-box 3, human

TSL 2

Gene TBX3, Length 1,814 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBX3-204	ENST00000552054	OR2F2	O95006	317 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	RLN2	P04090	185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	ZBTB25	P24278	435 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	CD34	P28906	385 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	BDKRB2	P30411	391 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	TSPAN7	P41732	249 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	GSK3A	P49840	483 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	RNF4	P78317	190 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	QRFP	P83859	136 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	HSF1	Q00613	529 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	OR2F1	Q13607	317 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	KMT5C	Q86Y97	462 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	RNF138	Q8WVD3	245 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	ST8SIA2	Q92186	375 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBX3-204	ENST00000552054	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	P2RY10	O00398	339 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	LMX1B	O60663	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	TBP	P20226	339 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	CD96	P40200	585 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	TGIF1	Q15583	401 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	LYG2	Q86SG7	212 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	FAM46B	Q96A09	425 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054		A0A1W2PNV4	684 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	SPDEF	O95238	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	TTR	P02766	147 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	UNC119	Q13432	240 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	OR7A5	Q15622	319 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	KDM8	Q8N371	416 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	DDIT4L	Q96D03	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ARL5B	Q96KC2	179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ACACA	Q13085	2346 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	BCL2L11	O43521	198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	TLE3	Q04726	772 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	C1orf189	Q5VU69	101 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	COX15	Q7KZN9	410 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	NPAS1	Q99742	590 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	GAL3ST1	Q99999	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	LDAH	Q9H6V9	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TBX3-204	ENST00000552054	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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