RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 DCTN6O00399 190 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 FZD7O75084 574 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CPMP14384 443 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.71□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.71□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 C22orf46C9J442 243 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FGF2P09038 288 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FOLR2P14207 255 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HOXA5P20719 270 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 AQP1P29972 269 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GNG4P50150 75 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 WNT7BP56706 349 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 AGBL4Q5VU57 503 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.71□□□□□ -1.5
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