RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 FAM57BQ71RH2 274 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 SPICQ8N5J4 248 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 THEM6Q8WUY1 208 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 SGK3Q96BR1 496 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 TEAD3Q99594 435 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 CIB1Q99828 191 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 SLC22A4Q9H015 551 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 PNPP00491 289 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 APOC1P02654 83 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 ACTR3P61158 418 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 FAM3AP98173 230 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 OR8G1Q15617 311 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 Q8TCH9 128 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 REEP6Q96HR9 211 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 SP140LQ9H930 580 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 COL6A5A8TX70 2615 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 PRR32B1ATL7 298 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 H3BNX3 289 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 GMDSO60547 372 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 FAM20BO75063 409 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 ZNF205O95201 554 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 AVPP01185 164 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 HCCSP53701 268 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 LCN2P80188 198 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 MPPED2Q15777 294 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 TIGD6Q17RP2 521 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 FAM201AQ5SY85 155 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 TMEM163Q8TC26 289 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 ERGIC1Q969X5 290 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 BRD7Q9NPI1 651 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 LRP12Q9Y561 859 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 A0A0G2JMP0 313 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 A0A0X1KG70 313 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 A8MXK9 166 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 FSTL3O95633 263 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 DDOSTP39656 456 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 PGAM5Q96HS1 289 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 PKP2Q99959 881 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 OR10A2Q9H208 303 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 TMEM165Q9HC07 324 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 COPS3Q9UNS2 423 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 LRRC30A6NM36 301 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 FOXH1O75593 365 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 GSK3AP49840 483 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 OR8B8Q15620 311 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 ZNF404Q494X3 552 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 KLBQ86Z14 1044 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CS-219ENST00000550655 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms