RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523237.1

CLN8-206, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, human

TSL 3

Gene CLN8, Length 835 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN8-206	ENST00000523237	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	SP140L	Q9H930	580 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	TBX1	O43435	398 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	FAM20B	O75063	409 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	FKBP6	O75344	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	FSHB	P01225	129 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	HMGN1	P05114	100 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	OSM	P13725	252 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	ANXA8	P13928	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	ANOS1	P23352	680 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	FPR2	P25090	351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	CX3CR1	P49238	355 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	GINS1	Q14691	196 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	MPPED2	Q15777	294 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	SPERT	Q8NA61	448 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	OR8B2	Q96RD0	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	SLC6A7	Q99884	636 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	POMP	Q9Y244	141 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN8-206	ENST00000523237	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PRKACG	P22612	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	DDOST	P39656	456 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	CDK5	Q00535	292 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	TIGD4	Q8IY51	512 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PRODH	O43272	600 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PITPNB	P48739	271 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	LYN	P07948	512 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	OPRL1	P41146	370 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ACTG1	P63261	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PAX8	Q06710	450 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	KCNJ8	Q15842	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	AMELY	Q99218	206 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	CLN8	Q9UBY8	286 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237		A6NLC8	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms