RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 GPR148Q8TDV2 347 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 FGGYQ96C11 551 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 OR10A2Q9H208 303 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 FZR1Q9UM11 496 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 SMPD2O60906 423 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 ACHEP22303 614 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 SDC2P34741 201 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 MXD1Q05195 221 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 Q499Y3 187 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 RNF144BQ7Z419 303 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 TMEM106AQ96A25 262 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 HHLA2Q9UM44 414 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 A0A0U1RQV5 110 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 SIAH2O43255 324 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 LILRA1O75019 489 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 APOC1P02654 83 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 CD40P25942 277 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 UCP2P55851 309 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM3AP98173 230 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 XKRXQ6PP77 449 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.65□□□□□ -0.06
TSNARE1-205ENST00000520166 A0A1B0GVI7 797 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 CDRT1O95170 752 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 UCHL1P09936 223 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 CCL1P22362 96 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 SERPINB10P48595 397 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 BSPH1Q075Z2 132 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF544Q6NX49 715 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 GFI1Q99684 422 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 TPK1Q9H3S4 243 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 ETAA1Q9NY74 926 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 DHDHQ9UQ10 334 aa14.64□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 FAHP16930 419 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 MPV17P39210 176 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 GSK3AP49840 483 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 OR10A3P58181 314 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 TRIM64BA6NI03 449 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 ADRA2CP18825 462 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 PPP1CBP62140 327 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 TRAM1Q15629 374 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 DOK3Q7L591 496 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 SPSB4Q96A44 273 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 RADILQ96JH8 1075 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 KCTD7Q96MP8 289 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 OR10A4Q9H209 315 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 V9GYS6 101 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 ROS1P08922 2347 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 ABCD4O14678 606 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 PLAUP00749 431 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 SERPINA3P01011 423 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 SRMP19623 302 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 CEP78Q5JTW2 689 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 OR2T2Q6IF00 324 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 LRP11Q86VZ4 500 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 NEUROG1Q92886 237 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 CMBLQ96DG6 245 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-205ENST00000520166 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms