RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC8AQ8IWT6 810 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MS4A15Q8N5U1 240 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHST4Q8NCG5 386 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNG3Q8TAE7 436 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHEBL1Q8TAI7 183 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PKNOX2Q96KN3 472 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYSTM1Q9H1C7 97 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSD3B7Q9H2F3 369 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLE4Q9NR33 117 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLIT2O94813 1529 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DENND4AQ7Z401 1863 aa-0.54□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PRQ8 180 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDZK1P1A8MUH7 402 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C17orf98A8MV24 154 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLL5B9A064 214 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0R1X1 148 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R2P9O14990 202 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARPC3O15145 178 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOX15O60248 233 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EEDO75530 441 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCO1O75880 301 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ETHE1O95571 254 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLIC3O95833 236 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TGM6O95932 706 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAS1P04201 325 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TALDO1P37837 337 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRPHP41219 470 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF266Q14584 549 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPATA8Q6RVD6 105 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OPN5Q6U736 354 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZSR3 168 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MDP1Q86V88 176 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPRMLQ8N4K4 120 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5C1Q8NGR4 320 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2A1Q8NGT9 310 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCEANC2Q96MN5 208 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM111AQ96PZ2 611 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5B12Q96R08 314 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR52B2Q96RD2 323 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MICU1Q9BPX6 476 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNS3Q9BQ31 491 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD19PQ9H560 264 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC19Q9H756 370 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CES1P1Q9UKY3 287 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FN1P02751 2386 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAMB4A4D0S4 1761 aa-0.55□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PPE3 182 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLDN9O95484 217 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV1D-33P01593 117 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV1-33P01594 117 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSMCR30P0CW71 290 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPA2P15927 270 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCND2P30279 289 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSR4P51571 173 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TATDN3Q17R31 274 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC36A3Q495N2 470 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM201AQ5SY85 155 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZQT7 251 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RTL4Q6ZR62 310 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HS3ST5Q8IZT8 346 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SDR9C7Q8NEX9 313 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4F6Q8NGB9 312 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8K1Q8NGG5 319 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR52E2Q8NGJ4 325 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENKURQ8TC29 256 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPACA4Q8TDM5 124 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RXFP4Q8TDU9 374 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CXorf40AQ8TE69 158 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCFD1Q8WVM8 642 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C10orf35Q96D05 121 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM237Q96Q45 408 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNK16Q96T55 309 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPA33Q99795 319 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B9D2Q9BPU9 175 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPZ1Q9BXG8 430 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP3A43Q9HB55 503 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED4Q9NPJ6 270 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM38BQ9NVV0 291 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUP50Q9UKX7 468 aa-0.56□□□□□ -2.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB22AQ9UL26 194 aa-0.56□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms