RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM11P17152 192 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUT3P21217 361 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSMB8P28062 276 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD200P41217 278 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDKN2DP55273 166 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAV3P56539 151 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GMFBP60983 142 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCBD1P61457 104 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ETF1P62495 437 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTA2P62736 377 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL31P62899 125 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTG2P63267 376 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTC1P68032 377 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTA1P68133 377 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAE1P78406 368 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 BASP1P80723 227 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPIBQ01892 262 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBXN1Q04323 297 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MGAT5Q09328 741 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GTF2H2Q13888 395 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNA13Q14344 377 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MPPED2Q15777 294 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SGO1Q5FBB7 561 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCST2Q5T1A1 773 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARMC4Q5T2S8 1044 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRTP1Q5TC63 336 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF691Q5VV52 312 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf140Q5VVS0 124 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX36Q5VZQ5 186 aa1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf111Q8N326 155 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 METTL4Q8N3J2 472 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX9Q8N6V9 391 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C5orf56Q8N8D9 126 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC89Q8N998 374 aa1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF114Q8NC26 417 aa1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 BPIFA3Q9BQP9 254 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 BTBD10Q9BSF8 475 aa1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 MAGT1Q9H0U3 335 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNTTIP1Q9H147 329 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 WNT5BQ9H1J7 359 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf21Q9H246 121 aa1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 YY1AP1Q9H869 796 aa1.39□□□□□ -2.19
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RNU6-548P-201ENST00000517083 OR6C3Q9NZP0 311 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLAMF8Q9P0V8 285 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPM3Q9P2X0 92 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 P2RX2Q9UBL9 471 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OSGIN1Q9UJX0 560 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIGLEC7Q9Y286 467 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 VWA7Q9Y334 891 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC100509620A0A075B734 347 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM120BA0PK00 339 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAGEB16A2A368 324 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 IZUMO1RA6ND01 250 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ODF3BA8MYP8 253 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 IQCF6A8MYZ5 107 aa1.38□□□□□ -2.19
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