RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	SEMG1	P04279	462 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CD96	P40200	585 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RFC3	P40938	356 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TFF2	Q03403	129 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF266	Q14584	549 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SHB	Q15464	509 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	EXT1	Q16394	746 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR1L3	Q8NH93	324 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CMTM3	Q96MX0	182 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LHX9	Q9NQ69	397 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RGS13	O14921	159 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TUSC2	O75896	110 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CD63	P08962	238 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GABRA2	P47869	451 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SRPX	P78539	464 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TESK1	Q15569	626 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MSMO1	Q15800	293 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ALG1L2	C9J202	215 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LRP3	O75074	770 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	JTB	O76095	146 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IRF2	P14316	349 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R1A	Q13522	171 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SP6	Q3SY56	376 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CST9LP1	Q5W188	147 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	VHLL	Q6RSH7	139 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GNG12	Q9UBI6	72 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OIP5	O43482	229 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PIAS2	O75928	621 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NRAS	P01111	189 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	B4GALT1	P15291	398 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CD46	P15529	392 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RAB31	Q13636	194 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LYPD8	Q6UX82	237 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR5AS1	Q8N127	324 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TTC9	Q92623	222 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MALSU1	Q96EH3	234 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	KIRREL1	Q96J84	757 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PLSCR5	A0PG75	271 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP92	A6NM28	416 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM127	O75204	238 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	WNT11	O96014	354 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HPN	P05981	417 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GRP	P07492	148 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TBP	P20226	339 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ECI1	P42126	302 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FUT5	Q11128	374 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PDCD1	Q15116	288 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ARL5B	Q96KC2	179 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf50	Q96LR7	162 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GNRHR2	Q96P88	292 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LANCL2	Q9NS86	450 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PLXNB2	O15031	1838 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	BCL2L11	O43521	198 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IFNA10	P01566	189 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HBE1	P02100	147 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25

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