RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509165.1

NFKB1-208, Transcript of nuclear factor kappa B subunit 1, human

TSL 5

Gene NFKB1, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFKB1-208	ENST00000509165	MTPN	P58546	118 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	TFF3	Q07654	80 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	STX4	Q12846	297 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	PPA1	Q15181	289 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	RCN1	Q15293	331 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	LTB4R	Q15722	352 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	MAPK11	Q15759	364 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	SAXO2	Q658L1	398 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	GLYAT	Q6IB77	296 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	HSDL2	Q6YN16	418 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165		Q6ZVQ6	151 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	ANKRD46	Q86W74	232 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	MICU2	Q8IYU8	434 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	RNF148	Q8N7C7	305 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	OR10A6	Q8NH74	314 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	SFXN5	Q8TD22	340 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	RIT1	Q92963	219 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	NEURL3	Q96EH8	262 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF559	Q9BR84	538 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	INPP5K	Q9BT40	448 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	VCX3B	Q9H321	246 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	UBQLN3	Q9H347	655 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	YY1AP1	Q9H869	796 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	C8orf4	Q9NR00	106 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	AP4S1	Q9Y587	144 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NFKB1-208	ENST00000509165	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165		A0A0G2JMM0	328 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165		A0A1W2PPB8	328 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165		A0A1W2PRS3	328 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	DHRS12	A0PJE2	317 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	PINLYP	A6NC86	204 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	C5orf52	A6NGY3	159 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	KLLN	B2CW77	178 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	CXCR6	O00574	342 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	OR2J2	O76002	312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	OR6B1	O95007	311 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	C6orf47	O95873	294 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	IFNA14	P01570	189 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	IGKV1D-16	P01601	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	C1QC	P02747	245 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	TFPT	P0C1Z6	253 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	CCL3	P10147	92 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	FAS	P25445	335 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	NTS	P30990	170 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	KDELR2	P33947	212 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	VHL	P40337	213 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	MAGEA2	P43356	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	SSR4	P51571	173 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	SELENOW	P63302	87 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	FUT5	Q11128	374 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	SELPLG	Q14242	412 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	GNA13	Q14344	377 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	GK3P	Q14409	553 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	OR1C1	Q15619	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	CYP51A1	Q16850	503 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	REEP3	Q6NUK4	255 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	OPN5	Q6U736	354 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NFKB1-208	ENST00000509165	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		3.08	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms