RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	CD163	Q86VB7	1156 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	GNRHR2	Q96P88	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	SOX7	Q9BT81	388 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	PROK2	Q9HC23	129 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	RP2	O75695	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	VAMP5	O95183	116 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	CHRM2	P08172	466 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	GNB3	P16520	340 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	MSR1	P21757	451 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	CXADR	P78310	365 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM156	Q8N614	296 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NTNG2	Q96CW9	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	SPACA5	Q96QH8	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	CTSS	P25774	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	DHRS2	Q13268	280 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NELFA	Q9H3P2	528 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	KIF25	Q9UIL4	384 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ZIC3	O60481	467 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	HCK	P08631	526 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	PPP3CB	P16298	524 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF17	P17021	662 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	TBP	P20226	339 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ARL6	Q9H0F7	186 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	HPF1	Q9NWY4	346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522		G3V3Y1	287 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	WDPCP	O95876	746 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	RRAS	P10301	218 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ANOS1	P23352	680 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	CD34	P28906	385 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	CASR	P41180	1078 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	FOLR3	P41439	243 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	MLF1	P58340	268 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	SORD	Q00796	357 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	OR52W1	Q6IF63	320 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	RNF144B	Q7Z419	303 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NICN1	Q9BSH3	213 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	MPIG6B	O95866	241 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PDGFA	P04085	211 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	HRH1	P35367	487 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OR3A4P	P47883	348 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms