RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CMAHPQ9Y471 501 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 R4GMQ9 66 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SPG11Q96JI7 2443 aa7.21□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM129A0AVI4 362 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ATE1O95260 518 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PF4P02776 101 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 HTR1AP08908 422 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 GCH1P30793 250 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 DCTDP32321 178 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TTKP33981 857 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINF1P36955 418 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MAP2K4P45985 399 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CDH15P55291 814 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ACTA2P62736 377 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ACTG2P63267 376 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF92Q03936 586 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ODF4Q2M2E3 257 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MST1LQ2TV78 715 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SYS1Q8N2H4 156 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 RORBQ92753 470 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SGK3Q96BR1 496 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 LYZL4Q96KX0 146 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 COG8Q96MW5 612 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SOX7Q9BT81 388 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10A2Q9H208 303 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SP140LQ9H930 580 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 DUSP13Q9UII6 198 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF114Q9Y508 228 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ACOD1A6NK06 481 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 VSTM5A8MXK1 200 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 H3BSH0 61 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 P2RY10O00398 339 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MYL12BO14950 172 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 XRCC2O43543 280 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 BPNT1O95861 308 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 LALBAP00709 142 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CD8AP01732 235 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TTRP02766 147 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MT-ND5P03915 603 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SOD3P08294 240 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 DANCRP0C864 163 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF250P15622 560 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 KIR3DL2P43630 455 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CHN2P52757 468 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 GABARAPL2P60520 117 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MALLQ13021 153 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PSG7Q13046 419 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 IRF3Q14653 427 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TIGD6Q17RP2 521 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR38Q5JTN6 314 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 XAF1Q6GPH4 301 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2T2Q6IF00 324 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF544Q6NX49 715 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 KLBQ86Z14 1044 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5AS1Q8N127 324 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MUC15Q8N387 334 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF611Q8N823 705 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms