RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CPOQ8IVL8 374 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 GJC3Q8NFK1 279 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A28Q96A46 364 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.88□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 ENTPD6O75354 484 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 SPI1P17947 270 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZNF81P51508 661 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 Q96MT0 163 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 POFUT1Q9H488 388 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ESM1Q9NQ30 184 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 NUP50Q9UKX7 468 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR6C6A6NF89 314 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 F5H5K5 113 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SLC1A7O00341 560 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-13P01766 116 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 AADACL4Q5VUY2 407 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SPATC1Q76KD6 591 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 COQ7Q99807 217 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ATF6BQ99941 703 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MRI1Q9BV20 369 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SLITRK2Q9H156 845 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 WDR76Q9H967 626 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GUS0 222 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 H3BSA7 217 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CLDN34H7C241 214 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PRODHO43272 600 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 XPNPEP2O43895 674 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MTNR1AP48039 350 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SLC6A9P48067 706 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ENTPD1P49961 510 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 LCN2P80188 198 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZNF91Q05481 1191 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 BAMBIQ13145 260 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 APOFQ13790 326 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 TAF13Q15543 124 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MIDNQ504T8 468 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR5AS1Q8N127 324 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PTP4A1Q93096 173 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 DDOQ99489 341 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 COPS4Q9BT78 406 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 AMBNQ9NP70 447 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CENPMQ9NSP4 180 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.85□□□□□ -0.83
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