RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 DOK3Q7L591 496 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 SYT13Q7L8C5 426 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 RAB3CQ96E17 227 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 CENPMQ9NSP4 180 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 CTSFQ9UBX1 484 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-202ENST00000428394 SPTBP11277 2137 aa14.96□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FAM25EA8MYX2 175 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MPZL1O95297 269 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CYC1P08574 325 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PGAM2P15259 253 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IGFBP4P22692 258 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CTSSP25774 331 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RNF4P78317 190 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FOXK1P85037 733 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR7A5Q15622 319 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 HFEQ30201 348 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 C10orf35Q96D05 121 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 C2orf50Q96LR7 162 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 C5orf34Q96MH7 638 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FREM3P0C091 2139 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FAM74A7A6NL05 159 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MFNGO00587 321 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 DUX1O43812 170 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CDC14BO60729 498 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IGHG1P01857 330 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CSN2P05814 226 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 AKR1C4P17516 323 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 AVPR2P30518 371 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 BLOC1S1P78537 153 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 S100A12P80511 92 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 KCTD9Q7L273 389 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR1L3Q8NH93 324 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NKD1Q969G9 470 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SMIM8Q96KF7 97 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RNF126Q9BV68 326 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CDC14CA4D256 554 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SERPINE3A8MV23 424 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PLATP00750 562 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GIMD1P0DJR0 217 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 HLA-DOBP13765 273 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PRF1P14222 555 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FMODQ06828 376 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 HMGN3Q15651 99 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SGCAQ16586 387 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 UEVLDQ8IX04 471 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR5AS1Q8N127 324 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GNB3P16520 340 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PLA2G5P39877 138 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 BIDP55957 195 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms