RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 OR2AE1Q8NHA4 323 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 FAM168AQ92567 244 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 Q96MF0 132 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TBX5Q99593 518 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 JAM3Q9BX67 310 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 PBOV1Q9GZY1 135 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TPK1Q9H3S4 243 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 MSL2Q9HCI7 577 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 AMBNQ9NP70 447 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 BRD7Q9NPI1 651 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 DLL4Q9NR61 685 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 IL19Q9UHD0 177 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SPRY3O43610 288 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 GMDSO60547 372 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 FAM20BO75063 409 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 HPXP02790 462 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 GNAO1P09471 354 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ATP6V1B1P15313 513 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SLC25A16P16260 332 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TNFRSF1AP19438 455 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 GIFP27352 417 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 VHLP40337 213 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 CRYBB2P43320 205 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 MAGEB1P43366 347 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM33P57088 247 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 CCL8P80075 99 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 OR8B8Q15620 311 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 CDONQ4KMG0 1287 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 LIPNQ5VXI9 398 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZR03 302 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SSX6Q7RTT6 188 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ELMOD2Q8IZ81 293 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 OR5AS1Q8N127 324 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SYS1Q8N2H4 156 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF525Q8N782 197 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SPERTQ8NA61 448 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SIGLEC11Q96RL6 698 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 CHODLQ9H9P2 273 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SAP30LQ9HAJ7 183 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 C5orf63A6NC05 138 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 NCR1O76036 304 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 PNPP00491 289 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 PIPP12273 146 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ACHEP22303 614 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ANOS1P23352 680 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 GSK3AP49840 483 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 MZT1Q08AG7 82 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 GALEQ14376 348 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TSTQ16762 297 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 KRT74Q7RTS7 529 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 CCDC54Q8NEL0 328 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 OR2Z1Q8NG97 314 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 OR8B12Q8NGG6 310 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 OR52I1Q8NGK6 324 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TMUB1Q9BVT8 246 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ANKRD60Q9BZ19 345 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TTTY10Q9BZA0 68 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ABCB9Q9NP78 766 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 G6PC2Q9NQR9 355 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 OR52A1Q9UKL2 312 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 IFNL4K9M1U5 179 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 LY6HO94772 140 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 RPP14O95059 124 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 IGLV3-1P01715 115 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 RPSAP08865 295 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 CD99P14209 185 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 SLC3A1Q07837 685 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 TNK1Q13470 666 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 MED21Q13503 144 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 HFEQ30201 348 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 C6orf52Q5T4I8 152 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-210ENST00000423693 BCL2L15Q5TBC7 163 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms