RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GX78 115 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf51A6NDU8 294 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKUB1A6NFN9 424 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 BPNT1O95861 308 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CLDN6P56747 220 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIAP62937 165 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL7P80098 99 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXF1Q12946 379 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM17Q86X19 198 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10S1Q8NGN2 331 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 U3KQA8 63 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 EFSO43281 561 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SSX5O60225 188 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 GP1BAP07359 652 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ICAM2P13598 275 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB3AP20336 220 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 COMMD2Q86X83 199 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CYYR1Q96J86 154 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM74A7A6NL05 159 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-GP17693 338 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf210Q8IVY1 113 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10R2Q8NGX6 335 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ST8SIA1Q92185 356 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX7Q9BT81 388 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC2A1P11166 492 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 C17orf67Q0P5P2 114 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ABOP16442 354 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 EMP2P54851 167 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 D2HGDHQ8N465 521 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1S2Q8NGQ3 325 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SAP25Q8TEE9 199 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 DDIT4LQ96D03 193 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHB10Q9UN67 800 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC400499M0QZD8 3231 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FRYQ5TBA9 3013 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TDGF1P13385 188 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 MPZP25189 248 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR1C2P52895 323 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR1C1Q04828 323 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM61Q5EBN2 209 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 MISPQ8IVT2 679 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4K15Q8NH41 348 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PHYHIPLQ96FC7 376 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6C1Q96RD1 312 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 UQCC2Q9BRT2 126 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SERINC1Q9NRX5 453 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF208O43345 1280 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PGAM2P15259 253 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF20P17024 532 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINF1P36955 418 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM104Q8NE00 496 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ARPC5LQ9BPX5 153 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 VSTM2BA6NLU5 285 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 MPIG6BO95866 241 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 DMRTC1Q5HYR2 192 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS20P59510 1910 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0A6YYD4 124 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 LIPT2A6NK58 231 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CDAP32320 146 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPPEQ6ZT21 453 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 DTWD2Q8NBA8 298 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 APCDD1LQ8NCL9 501 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6S1Q8NH40 331 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 DCUN1D4Q92564 292 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM41AQ96HV5 264 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM117AQ9C073 453 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 BANF2Q9H503 90 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SDK2Q58EX2 2172 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 URB1O60287 2271 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM14DPA8MWL7 114 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 EFNA2O43921 213 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 WDPCPO95876 746 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CRHP06850 196 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMB6P28072 239 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 GFOD2Q3B7J2 385 aa16.53■□□□□ 0.24
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