RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 NIPAL2Q9H841 368 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 HAO2Q9NYQ3 351 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM178BH3BS89 294 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNL4K9M1U5 179 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMD9O00233 223 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GMDSO60547 372 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ANPEPP15144 967 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 DEGS2Q6QHC5 323 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 MOGAT3Q86VF5 341 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 PRIMA1Q86XR5 153 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GID4Q8IVV7 300 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 OR56B2PQ8NGI1 322 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8J1Q8NGP2 316 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ASB17Q8WXJ9 295 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SIGLEC11Q96RL6 698 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GAL3ST1Q99999 423 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 MROQ9BYG7 248 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SHARPINQ9H0F6 387 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 LPAR2Q9HBW0 351 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 COPS3Q9UNS2 423 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 LRP12Q9Y561 859 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV2-70P01814 119 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV2-5P01817 119 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CFL1P23528 166 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 PMELP40967 661 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CD200P41217 278 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 MMP16P51512 607 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC42P60953 191 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GFOD2Q3B7J2 385 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM120AOSQ5T036 256 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2FQ969M7 185 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB39BQ96DA2 213 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRL4Q9HBW9 690 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 LPAR3Q9UBY5 353 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SONP18583 2426 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF254O75437 659 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 BAG2O95816 211 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 MSMBP08118 114 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 HTR1FP30939 366 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GATA4P43694 442 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GSK3AP49840 483 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ROM1Q03395 351 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CR1LQ2VPA4 569 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35F2Q8IXU6 374 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF679Q8IYX0 411 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 PQLC1Q8N2U9 271 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SPERTQ8NA61 448 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ERGIC1Q969X5 290 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 HRASLS5Q96KN8 279 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8B4Q96RC9 309 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 MNTQ99583 582 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC29A1Q99808 456 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 C9orf16Q9BUW7 83 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 RGCCQ9H4X1 137 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 UBAP1Q9NZ09 502 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ACOD1A6NK06 481 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC30A6NM36 301 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR32B1ATL7 298 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 DCTDP32321 178 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 BTG1P62324 171 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMYND11Q15326 602 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF181Q2M3W8 571 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 GLCCI1Q86VQ1 547 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 KLBQ86Z14 1044 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 OR51G2Q8NGK0 314 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 OR51F2Q8NH61 342 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 EME1Q96AY2 570 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM186Q96B77 213 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 HIF1ANQ9NWT6 349 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 CLN6Q9NWW5 311 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHB10Q9UN67 800 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 E9PQ18 207 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PLPP2O43688 288 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF205O95201 554 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCR4P61073 352 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MPPED2Q15777 294 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM155Q4W5P6 130 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 IL17RELQ6ZVW7 336 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8B12Q8NGG6 310 aa17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms