RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 PGAP1Q75T13 922 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 CENPSQ8N2Z9 138 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 Q8N402 240 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 C19orf18Q8NEA5 215 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 OR6M1Q8NGM8 313 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 SETD6Q8TBK2 473 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 TAAR6Q96RI8 345 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 GFI1Q99684 422 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 SOSTQ9BQB4 213 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 WNT5BQ9H1J7 359 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 C12orf49Q9H741 205 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 MALT1Q9UDY8 824 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF391Q9UJN7 358 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 APC2O95996 2303 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 A0A096LPE4 126 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0B4J203 849 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1B0GTI1 187 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1B0GVG6 124 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PPZ6 126 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 SLC17A2O00624 439 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 MAGEB3O15480 346 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 UBL3O95164 117 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PTTG1O95997 202 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PDGFAP04085 211 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 LCATP04180 440 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 DBHP09172 617 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PATE4P0C8F1 98 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 COX5BP10606 129 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 CD79AP11912 226 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 GABRA1P14867 456 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 CRYGSP22914 178 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 HTR2CP28335 458 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PTGER4P35408 488 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 THBS4P35443 961 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 DDOSTP39656 456 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 TGFBR3Q03167 851 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 SPOCK1Q08629 439 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 OXA1LQ15070 435 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 P2RY14Q15391 338 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF79Q15937 498 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 HACD4Q5VWC8 232 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PRSS45Q7RTY3 260 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 CDH26Q8IXH8 852 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 OR1J2Q8NGS2 313 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 OR5H6Q8NGV6 325 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 SLC7A6Q92536 515 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 PHF21AQ96BD5 680 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 C10orf35Q96D05 121 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 GPR137Q96N19 417 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 RGCCQ9H4X1 137 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 NEK6Q9HC98 313 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 FRYQ5TBA9 3013 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 AKAP13Q12802 2813 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0G2JMP0 313 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0X1KG70 313 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PQ09 198 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC8-211ENST00000415409 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms