RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 K7ESM1 405 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 PRRG2O14669 202 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 SH2D1BO14796 132 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 F10P00742 488 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF250P15622 560 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 CYB561P49447 251 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 SLC17A1Q14916 467 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 RLN3Q8WXF3 142 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 EMC6Q9BV81 110 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 V9GYS6 101 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 NTF3P20783 257 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 EDDM3AQ14507 147 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 AGBL4Q5VU57 503 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 LHX4Q969G2 390 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 HES7Q9BYE0 225 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 AK3Q9UIJ7 227 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 DSCR3O14972 297 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 CIDEAO60543 219 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ADAM11O75078 769 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 STAG3L2P0CL84 134 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 EDN3P14138 238 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 AVPR2P30518 371 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 SSX1Q16384 188 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 OR51H1Q8NH63 302 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 CRLF2Q9HC73 371 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 TLCD2A6NGC4 264 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ZP3P21754 424 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 B4GALNT1Q00973 533 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 DHODHQ02127 395 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 GUCA2AQ02747 115 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 CDKN3Q16667 212 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ST3GAL2Q16842 350 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 CORO6Q6QEF8 472 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 CAMKMTQ7Z624 323 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 SBF2Q86WG5 1849 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 OR5G3P0C626 314 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ARR3P36575 388 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 CRYBB2P43320 205 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 GPR12P47775 334 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 HTRA3P83110 453 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 OR8G1Q15617 311 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 SYS1Q8N2H4 156 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 GALNT16Q8N428 558 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 G3V3Y1 287 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 OPRM1P35372 400 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF573Q86YE8 665 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 TVP23CQ96ET8 276 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 FGF21Q9NSA1 209 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 TBX21Q9UL17 535 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ORM1P02763 201 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 WNT1P04628 370 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ATF1P18846 271 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 HRH1P35367 487 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 GPR85P60893 370 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 GPNMBQ14956 572 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 EMC4Q5J8M3 183 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 HLA-CQ95604 372 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM230Q96A57 120 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 SARAFQ96BY9 339 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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