RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM157AC9JC47 383 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PHYHO14832 338 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 WNT9BO14905 357 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MLNRO43193 412 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 NDUFA2O43678 99 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PLPP2O43688 288 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ALOX5APP20292 161 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC2A5P22732 501 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ERFP50548 548 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF92Q03936 586 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMED1Q13445 227 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 APOFQ13790 326 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8G1Q15617 311 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNJ8Q15842 424 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LIPNQ5VXI9 398 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 KRT77Q7Z794 578 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GID4Q8IVV7 300 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM163Q8TC26 289 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MROQ9BYG7 248 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 METRNQ9UJH8 293 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CACNG2Q9Y698 323 aa7.17□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0A6YYJ9 748 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZAR1LA6NP61 321 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 F5H5P2 479 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TBX1O43435 398 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SELENOFO60613 162 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PNPP00491 289 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6V1B1P15313 513 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CA6P23280 308 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MMP16P51512 607 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 EFNB1P98172 346 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ROM1Q03395 351 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 POU4F2Q12837 409 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZMYND11Q15326 602 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ESCO2Q56NI9 601 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SPRNQ5BIV9 151 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 C12orf73Q69YU5 71 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM57BQ71RH2 274 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATC1Q76KD6 591 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RFKQ969G6 155 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SGK3Q96BR1 496 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 REEP6Q96HR9 211 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PGAM5Q96HS1 289 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM165Q9HC07 324 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF7Q9UBF6 113 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.16□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0U1RQV5 110 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SNTNA6NMZ2 147 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 A8MXK9 166 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 H0YL77 283 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PRKYO43930 277 aa7.15□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms