RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD70P32970 193 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR12D2P58182 307 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 BPIFB3P59826 476 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 C9orf135Q5VTT2 229 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD300LGQ6UXG3 332 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 BBS7Q8IWZ6 715 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 ORMDL3Q8N138 153 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPATA4Q8NEY3 305 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 RXFP4Q8TDU9 374 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNS3Q9BQ31 491 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERP44Q9BS26 406 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 HRASLS2Q9NWW9 162 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC22A7Q9Y694 548 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 CR1P17927 2039 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 GBF1Q92538 1859 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 NOTCH1P46531 2555 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 IZUMO1RA6ND01 250 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 GMFGO60234 142 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAS1P04201 325 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERPINE2P07093 398 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 P0DMU3 169 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM231AP0DMU4 169 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM231CP0DMU5 169 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 IL32P24001 234 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMED10P49755 219 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPMTP51580 245 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFA8P51970 172 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 IFITM3Q01628 133 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 FMODQ06828 376 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 BST2Q10589 180 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF266Q14584 549 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSC22D1Q15714 1073 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS26BQ4G0F5 336 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 OPN5Q6U736 354 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 FA2HQ7L5A8 372 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF606Q8WXB4 792 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 HAUS1Q96CS2 278 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 METTL7AQ9H8H3 244 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 INIPQ9NRY2 104 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 HES2Q9Y543 173 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 SSH2Q76I76 1423 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-601P-201ENST00000384540 KANK1Q14678 1352 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 XKRY2A2RUG3 117 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 A6NDN8 102 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 SYCE1LA8MT33 242 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB29O14966 203 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 NMT2O60551 498 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAD1O60671 282 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 NRASP01111 189 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 HRASP01112 189 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRASP01116 189 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 BMI1P35226 326 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEMG2Q02383 582 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 LIPEQ05469 1076 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 ART3Q13508 389 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 PMF1Q6P1K2 205 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 DRAM1Q8N682 238 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR51E1Q8TCB6 317 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 NRBF2Q96F24 287 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 BTN2A3PQ96KV6 586 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC29A1Q99808 456 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 RACGAP1Q9H0H5 632 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 VSIRQ9H7M9 311 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 DCAF16Q9NXF7 216 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLEC4AQ9UMR7 237 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 STARD10Q9Y365 291 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATG2BQ96BY7 2078 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 ISPDA4D126 451 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 H3BQ85 93 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSCAO43653 123 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 FLOT1O75955 427 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 S1PR2O95136 353 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGHMP01871 453 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 THRAP10827 490 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF708P17019 499 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCK1P35558 622 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 LGALS7P47929 136 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 CBLN2Q8IUK8 224 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms