RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SLC24A5Q71RS6 500 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SZRD1Q7Z422 152 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SCD5Q86SK9 330 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 VRK2Q86Y07 508 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MARCH9Q86YJ5 346 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SIAH3Q8IW03 269 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF619Q8N2I2 560 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HDDC3Q8N4P3 179 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SLC5A8Q8N695 610 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC52Q8N7C0 313 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR10G2Q8NGC3 310 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR5B17Q8NGF7 314 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR56B1Q8NGI3 324 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR52I1Q8NGK6 324 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 POF1BQ8WVV4 589 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 KCNE4Q8WWG9 221 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MAFIPQ8WZ33 124 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PIGBQ92521 554 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ARL11Q969Q4 196 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TADA1Q96BN2 335 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ARSGQ96EG1 525 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CLCC1Q96S66 551 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 FEVQ99581 238 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 DDA1Q9BW61 102 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MID1IP1Q9NPA3 183 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OSER1Q9NX31 292 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MARCH5Q9NX47 278 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 IL17CQ9P0M4 197 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 COMMD3Q9UBI1 195 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 FBXL4Q9UKA2 621 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PCTPQ9UKL6 214 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CAMK2AQ9UQM7 478 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 VWA8A3KMH1 1905 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PLXNA2O75051 1894 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GW64 132 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CDRT15L2A8MXV6 281 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM238C9JI98 176 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 J3QRE1 110 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 K7ERQ8 282 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SULT2B1O00204 365 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 GABRPO00591 440 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 LDLRAD4O15165 306 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 RRP8O43159 456 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PLPP2O43688 288 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 FMO6PO60774 539 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TOXO94900 526 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 DIRAS3O95661 229 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 RAB36O95755 333 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HLA-DPB1P04440 258 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CD14P08571 375 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CTXN2P0C2S0 81 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NBEAP1P0C6P0 100 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 LIMS3P0CW19 117 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 LIMS4P0CW20 117 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 FGF7P21781 194 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 G0S2P27469 103 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PSMB6P28072 239 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HTR2CP28335 458 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PCGF2P35227 344 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 RAD52P43351 418 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 XCR1P46094 333 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 F2RL1P55085 397 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CAV3P56539 151 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 DAOAP59103 153 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SELENOTP62341 195 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CDK6Q00534 326 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TLE2Q04725 743 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.7 ms