RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 MMP16P51512 607 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 ZNF92Q03936 586 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 SNAPC1Q16533 368 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 SNAI3Q3KNW1 292 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 AVPI1Q5T686 147 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 LYPD4Q6UWN0 246 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 SLC16A9Q7RTY1 509 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 OR5AS1Q8N127 324 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 FTMTQ8N4E7 242 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 OR6N2Q8NGY6 317 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 TEAD3Q99594 435 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 ABCB9Q9NP78 766 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 TRIM36Q9NQ86 728 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 KRT84Q9NSB2 600 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 HAO2Q9NYQ3 351 aa13.09□□□□□ -0.31
NSL1-201ENST00000366976 GGT3PA6NGU5 568 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 F5H0A9 414 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ZNF254O75437 659 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 SBK2P0C263 348 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 PRKXP51817 358 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 MAB21L1Q13394 359 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 SPRNQ5BIV9 151 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 LCN1P1Q5VSP4 162 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 SLX4IPQ5VYV7 408 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ZFP1Q6P2D0 407 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ASB17Q8WXJ9 295 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 OR10A2Q9H208 303 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 NARFLQ9H6Q4 476 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 MED20Q9H944 212 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 C14orf119Q9NWQ9 140 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 MIOXQ9UGB7 285 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 PCDHB10Q9UN67 800 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 LRCH1Q9Y2L9 728 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 DYSFO75923 2080 aa13.08□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 SVEP1Q4LDE5 3571 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ZAR1LA6NP61 321 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 NDUFA2O43678 99 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 H2BFMP0C1H6 154 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 PPIAL4GP0DN37 164 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 CX3CR1P49238 355 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ACTR3P61158 418 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ROM1Q03395 351 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ZMYND11Q15326 602 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 OR8G1Q15617 311 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 KCNJ8Q15842 424 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 GLYATL3Q5SZD4 288 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 LIPNQ5VXI9 398 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 NXNL2Q5VZ03 156 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 OR11L1Q8NGX0 322 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 OTULINQ96BN8 352 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 SGK3Q96BR1 496 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 TMEM165Q9HC07 324 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 TVP23BQ9NYZ1 205 aa13.07□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ISPDA4D126 451 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 SLC22A31A6NKX4 558 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 F5H5P2 479 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 H0YL77 283 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 PHYHO14832 338 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 WNT2P09544 360 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 IRF2P14316 349 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ATP6V1B1P15313 513 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 CFHR2P36980 270 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 SRP14P37108 136 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 FAM3AP98173 230 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 TMED1Q13445 227 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 KLHL12Q53G59 568 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 C12orf73Q69YU5 71 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 CCDC121Q6ZUS5 278 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 USP43Q70EL4 1123 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 BHLHE23Q8NDY6 225 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 OR10AD1Q8NGE0 317 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ZFAND2BQ8WV99 257 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 FN3KRPQ9HA64 309 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 LAMP5Q9UJQ1 280 aa13.06□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 A0A0U1RQV5 110 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 CA6P23280 308 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 APOFQ13790 326 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 OR8B8Q15620 311 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 TIGD6Q17RP2 521 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 ZNF404Q494X3 552 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 AADACL4Q5VUY2 407 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 DCAF12L2Q5VW00 463 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 TMEM236Q5W0B7 351 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 GID4Q8IVV7 300 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 TMEM163Q8TC26 289 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 THEM6Q8WUY1 208 aa13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
NSL1-201ENST00000366976 FAHD2AQ96GK7 314 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms