RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPV17P39210 176 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 IDH2P48735 452 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSDL1Q3SXM5 330 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHL12Q53G59 568 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 MED27Q6P2C8 311 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRSS54Q6PEW0 395 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBPL2Q6SJ96 375 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZYG11AQ6WRX3 759 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RTL4Q6ZR62 310 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADM2Q7Z4H4 148 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 MDP1Q86V88 176 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERO1BQ86YB8 467 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 C19orf18Q8NEA5 215 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR1L1Q8NH94 360 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RXFP4Q8TDU9 374 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 HGDQ93099 445 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR82Q96P67 336 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 UQCC2Q9BRT2 126 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 NEK6Q9HC98 313 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTTG3PQ9NZH4 202 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 SVILO95425 2214 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 H7C0C1 242 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0R3G1 203 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 WBP4O75554 376 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OXTP01178 125 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV2-8P01709 118 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV6-57P01721 117 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 HBE1P02100 147 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASGR1P07306 291 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTRB1P17538 263 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 HTR1DP28221 377 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PFN2P35080 140 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP5OP48047 213 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB7AP51149 207 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRKCDQ05655 676 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 LUZP6Q538Z0 58 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OPN5Q6U736 354 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPESP1Q6UW49 350 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2Z1Q8NG97 314 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4C5Q8NGB2 326 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR10W1Q8NGF6 305 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRGNQ92686 78 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPEQ96AT9 228 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 C8orf44Q96CB5 159 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SGTBQ96EQ0 304 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRRC1Q96M27 445 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4K3Q96R72 315 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PANX1Q96RD7 426 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TM2D3Q9BRN9 247 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 UCK2Q9BZX2 261 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZYG11BQ9C0D3 744 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TOLLIPQ9H0E2 274 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF160Q9HCG1 818 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 RGS18Q9NS28 235 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLN6Q9NWW5 311 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCAF16Q9NXF7 216 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC42Q9Y546 428 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBN2Q6ZU65 1347 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 NINLQ9Y2I6 1382 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 NLRC5Q86WI3 1866 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CACNA1DQ01668 2161 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 THADAQ6YHU6 1953 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR6C70A6NIJ9 312 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR7C2O60412 319 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAD1O60671 282 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GATBO75879 557 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCNB2O95067 398 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNX4O95219 450 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGM6O95932 706 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GLAP06280 429 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PFN1P07737 140 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLTAP09496 248 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GABRG2P18507 467 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRKACBP22694 351 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GGT2P36268 569 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYCNOSP40205 109 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GALR1P47211 349 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB9AP51151 201 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 FABP6P51161 128 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CARD17Q5XLA6 110 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 HCP5Q6MZN7 132 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD300LGQ6UXG3 332 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCD5Q86SK9 330 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 HORMAD1Q86X24 394 aa1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms