RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CORO2AQ92828 525 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 G3V3Q6 166 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 HES4Q9HCC6 221 aa9.57□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C7orf72A4D263 438 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DSCR3O14972 297 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 XRCC2O43543 280 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 T-ENOLP0DO92 83 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.57□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF77Q15935 545 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 NTN4Q9HB63 628 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ADGRL4Q9HBW9 690 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ADRA2CP18825 462 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PGFP49763 221 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TCTAP57738 103 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SRPXP78539 464 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SARAFQ96BY9 339 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ESPL1Q14674 2120 aa9.57□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 FAHP16930 419 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PLAURQ03405 335 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 VPS25Q9BRG1 176 aa9.57□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF596Q8TC21 504 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 HMGN4O00479 90 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 KRASP01116 189 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DUSP6Q16828 381 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 NKAIN3Q8N8D7 197 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 UMAD1C9J7I0 102 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SPINK14Q6IE38 97 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR2L13Q8N349 312 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.56□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 CA6P23280 308 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RFX2P48378 723 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.56□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RFESDQ8TAC1 157 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF583Q96ND8 569 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C9orf172C9J069 976 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PPP5D1E7EU14 171 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 HAX1O00165 279 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TCEAL1Q15170 157 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 AGBL4Q5VU57 503 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.56□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LYG1Q8N1E2 194 aa9.56□□□□□ -0.88
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