RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 IGHV2-70P01814 119 aa21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 BTG1P62324 171 aa21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 LRRN1Q6UXK5 716 aa21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 IL4I1Q96RQ9 567 aa21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 PKP2Q99959 881 aa21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 YIPF3Q9GZM5 350 aa21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa21.47■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC182A6NF36 153 aa21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 LRRC30A6NM36 301 aa21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM178BH3BS89 294 aa21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 IRF2P14316 349 aa21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 C12orf73Q69YU5 71 aa21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 KLHL36Q8N4N3 616 aa21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 SPICQ8N5J4 248 aa21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 OR56B2PQ8NGI1 322 aa21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM163Q8TC26 289 aa21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CTXN1-201ENST00000318978 TRAV20A0A0B4J274 112 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 A0A1B0GWJ7 208 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 GMDSO60547 372 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 ALOX5APP20292 161 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 SRP14P37108 136 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 ZMYND11Q15326 602 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 SPSB4Q96A44 273 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 SGK3Q96BR1 496 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 FAHD2AQ96GK7 314 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 SIGLEC11Q96RL6 698 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 OSBPL10Q9BXB5 764 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 UFSP2Q9NUQ7 469 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.45■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 PSMD9O00233 223 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 PLPP2O43688 288 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF205O95201 554 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 CFL1P23528 166 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 CD200P41217 278 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 MAB21L1Q13394 359 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 NXNL2Q5VZ03 156 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 C1orf87Q8N0U7 546 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 OR11L1Q8NGX0 322 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 NIPAL2Q9H841 368 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 LRP12Q9Y561 859 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa21.44■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 SLC22A31A6NKX4 558 aa21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 H3BNX3 289 aa21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 DDOSTP39656 456 aa21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 MDH2P40926 338 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 FAM3AP98173 230 aa21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM155Q4W5P6 130 aa21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 PRSS45Q7RTY3 260 aa21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 GID4Q8IVV7 300 aa21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 MROQ9BYG7 248 aa21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 TTTY10Q9BZA0 68 aa21.43■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 LCN2P80188 198 aa21.42■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 MZT1Q08AG7 82 aa21.42■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 AADACL4Q5VUY2 407 aa21.42■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 OR8S1Q8NH09 359 aa21.42■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 ASB17Q8WXJ9 295 aa21.42■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 ERGIC1Q969X5 290 aa21.42■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 GABARAPL3Q9BY60 117 aa21.42■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF319Q9P2F9 582 aa21.42■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 IKZF2Q9UKS7 526 aa21.42■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 GATA4P43694 442 aa21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 GSK3AP49840 483 aa21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 EFNB1P98172 346 aa21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF181Q2M3W8 571 aa21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 KLBQ86Z14 1044 aa21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 SPERTQ8NA61 448 aa21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 RGCCQ9H4X1 137 aa21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 FN3KRPQ9HA64 309 aa21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 EI24O14681 340 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 FAM20BO75063 409 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 PNPP00491 289 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 GRPP07492 148 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 GNALP38405 381 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 PMELP40967 661 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 MPPED2Q15777 294 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 DCAF12L2Q5VW00 463 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 DEGS2Q6QHC5 323 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 SLC35F2Q8IXU6 374 aa21.4■■□□□ 1.02
CTXN1-201ENST00000318978 C14orf119Q9NWQ9 140 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms