RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 HLA-DOBP13765 273 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 THBS4P35443 961 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 IL34Q6ZMJ4 242 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 YIF1AO95070 293 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 TESK1Q15569 626 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 TIGD3Q6B0B8 471 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 RAB35Q15286 201 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ASPDHA6ND91 283 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 OR5H8P0DN80 308 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 CD1EP15812 388 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ARL16Q0P5N6 197 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SLC30A7Q8NEW0 376 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SLC35B4Q969S0 331 aa18.2■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ATF1P18846 271 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 NAA40Q86UY6 237 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 LRP12Q9Y561 859 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 TMEM11P17152 192 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 FCGR2CP31995 323 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ALKBH6Q3KRA9 238 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 OR2Y1Q8NGV0 311 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 EDARADDQ8WWZ3 215 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SPRY3O43610 288 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ADRA2CP18825 462 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SRD5A2P31213 254 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SLC25A1P53007 311 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ZIC1Q15915 447 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 FBXL14Q8N1E6 418 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 CT55Q8WUE5 264 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 BMP5P22003 454 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 OR10R2Q8NGX6 335 aa18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 K7EQM0 130 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 TBPP20226 339 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 RPS16P62249 146 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 FN3KRPQ9HA64 309 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 NPBWR1P48145 328 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ASAH1Q13510 395 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SOHLH1Q5JUK2 328 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ZFP82Q8N141 532 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 FAM109AQ8N4B1 249 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 OR4Q3Q8NH05 313 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 OR10D3Q8NH80 312 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 GPR87Q9BY21 358 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SAMD10Q9BYL1 202 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 A0A0B4J203 849 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 MSRB3Q8IXL7 192 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 COMMD5Q9GZQ3 224 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 OCIAD1Q9NX40 245 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SCN1AP35498 2009 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 C12orf73Q69YU5 71 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 DRAM2Q6UX65 266 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 HOXD12P35452 270 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ORAI1Q96D31 301 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 DMRTC1Q5HYR2 192 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 NTN4Q9HB63 628 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 PSMB3P49720 205 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 GPM6AP51674 278 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 FAM74A1Q5RGS3 127 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SLC7A6Q92536 515 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 RPS10P46783 165 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 EVX1P49640 407 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ZNF83P51522 516 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 FMODQ06828 376 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 C20orf141Q9NUB4 165 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 TCFL5Q9UL49 500 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ARPC3O15145 178 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 FUT7Q11130 342 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 SSX2Q16385 188 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 NUBPLQ8TB37 319 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 ZG16BQ96DA0 208 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 CCL4P13236 92 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 HMGN3Q15651 99 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 THNSL2Q86YJ6 484 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 OR2G3Q8NGZ4 309 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 HPP00738 406 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 CT62P0C5K7 136 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
USP25-202ENST00000285681 GPR32P1Q8NGA4 272 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms