RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236192.11

VAMP4-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-201ENST00000236192 AMER3Q8N944 861 aa11.65□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 PGAM5Q96HS1 289 aa11.65□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 FGF16O43320 207 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 GJA4P35212 333 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF85Q03923 595 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 LHX4Q969G2 390 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SLC35E1Q96K37 410 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 TP53I11O14683 189 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ABHD16AO95870 558 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 MEP1BQ16820 701 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SUMF1Q8NBK3 374 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SLC6A18Q96N87 628 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 DGAT2Q96PD7 388 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 GLIPR1P48060 266 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 EGR3Q06889 387 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 IL36AQ9UHA7 158 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 CXCL9Q07325 125 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 BSXQ3C1V8 233 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 EOGTQ5NDL2 527 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 TMEM64Q6YI46 380 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.64□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 A0A1W2PPE3 182 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 C1orf105O95561 183 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SNU13P55769 128 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 NRSN2Q9GZP1 204 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 PMELP40967 661 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 LIMS1P48059 325 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SUSD6Q92537 303 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SLC22A12Q96S37 553 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 MOB1AQ9H8S9 216 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF286AQ9HBT8 521 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 A6NNC1 897 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 CLEC3AO75596 197 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 PPP2CBP62714 309 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 PPP2CAP67775 309 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 Q7L0L9 218 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 OR10A5Q9H207 317 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 LHX9Q9NQ69 397 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ETHE1O95571 254 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 TNFSF4P23510 183 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 DCAF10Q5QP82 559 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 PHF19Q5T6S3 580 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 VHLLQ6RSH7 139 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ACOT4Q8N9L9 421 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 OR5AR1Q8NGP9 310 aa11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 TRDCB7Z8K6 153 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 OR1D2P34982 312 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SPATA45Q537H7 98 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 GATSQ8NAP1 163 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 SMIM8Q96KF7 97 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 AQP10Q96PS8 301 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 STACQ99469 402 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 PRSS50Q9UI38 385 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ZFPL1O95159 310 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 MSX1P28360 303 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 FZD2Q14332 565 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 IL13RA2Q14627 380 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 Q6ZVU0 165 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 OR4N5Q8IXE1 308 aa11.62□□□□□ -0.55
VAMP4-201ENST00000236192 MORN4Q8NDC4 146 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms