RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226359.2

AFP-201, Transcript of alpha fetoprotein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AFP, Length 1,914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFP-201ENST00000226359 PPOXP50336 477 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 EFNA4P52798 201 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 PCBD1P61457 104 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 LTBQ06643 244 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 MOGQ16653 247 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ARL9Q6T311 187 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 WDR88Q6ZMY6 472 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 DOK3Q7L591 496 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 NKAIN4Q8IVV8 208 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ENTHD1Q8IYW4 607 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 OR4K5Q8NGD3 323 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 SLC7A13Q8TCU3 470 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ASB10Q8WXI3 467 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 RORBQ92753 470 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TMEM54Q969K7 222 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TXNDC15Q96J42 360 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 Q96MT0 163 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ZNF426Q9BUY5 554 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TEX12Q9BXU0 123 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TXNIPQ9H3M7 391 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 PLK3Q9H4B4 646 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 CA10Q9NS85 328 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TMEM38BQ9NVV0 291 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ERVK-18Q9QC07 812 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 PEMTQ9UBM1 199 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 POLR1DQ9Y2S0 133 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 A0A1W2PPE2 198 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 A0A1W2PPW3 197 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 A0A1W2PR64 198 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 F5H697 171 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 NDUFS8O00217 210 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ZFPL1O95159 310 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 LYPD3O95274 346 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 IGLV1-44P01699 117 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 IGHV4-39P01824 125 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 OR4A8P0C604 315 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 PGA4P0DJD7 388 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 PGA3P0DJD8 388 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 CPT2P23786 658 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ACVR1BP36896 505 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 RPL27P61353 136 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TNK1Q13470 666 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 EFNB3Q15768 340 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 GPR107Q5VW38 600 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 LAIR2Q6ISS4 152 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 C1orf94Q6P1W5 598 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 B3GLCTQ6Y288 498 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 ZNF627Q7L945 461 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 LINGO2Q7L985 606 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 NRMQ8IXM6 262 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 STX19Q8N4C7 294 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 MOSPD2Q8NHP6 518 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 RHOXF1Q8NHV9 184 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TEX47Q8TBZ9 253 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 C17orf50Q8WW18 174 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 LIPHQ8WWY8 451 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 PRSS27Q9BQR3 290 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 REG4Q9BYZ8 158 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 DUSP21Q9H596 190 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.89□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 HEATR5AQ86XA9 2040 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 A0A087WUU8 490 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 EFCAB10A6NFE3 127 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 E9PQ18 207 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 M0R233 179 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 SOX14O95416 240 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 IGHMP01871 453 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 MT-ND2P03891 347 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 HNF1AP20823 631 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 PRKCDQ05655 676 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 TSPAN31Q12999 210 aa4.88□□□□□ -1.63
AFP-201ENST00000226359 GINS1Q14691 196 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms