RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		12	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ISPD	A4D126	451 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	PRODH	O43272	600 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SBK2	P0C263	348 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	FAM157C	P0CG43	387 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SLC2A5	P22732	501 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	EPHA2	P29317	976 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SLC15A1	P46059	708 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ESRRG	P62508	458 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	NPTN	Q9Y639	398 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	GGT3P	A6NGU5	568 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179		M0R129	80 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	TBX1	O43435	398 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	PRKY	O43930	277 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV2-5	P01817	119 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	MSMB	P08118	114 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	FCGR1A	P12314	374 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	HSD11B1	P28845	292 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	CX3CR1	P49238	355 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	HCCS	P53701	268 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	APOF	Q13790	326 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	THEM6	Q8WUY1	208 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	RAB39B	Q96DA2	213 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	GAL3ST1	Q99999	423 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	GCM1	Q9NP62	436 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179		A0A1B0GWJ7	208 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	CCDC182	A6NF36	153 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	PLPP2	O43688	288 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	IFNA2	P01563	188 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	LYN	P07948	512 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	H2BFM	P0C1H6	154 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SRD5A1	P18405	259 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	CA6	P23280	308 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	OPRL1	P41146	370 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	MMP16	P51512	607 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	FAM57B	Q71RH2	274 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	OR51F2	Q8NH61	342 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	TEAD3	Q99594	435 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	TOR3A	Q9H497	397 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM178B	H3BS89	294 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	XRCC2	O43543	280 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF205	O95201	554 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ANPEP	P15144	967 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	HNF1A	P20823	631 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	PMEL	P40967	661 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ACTR3	P61158	418 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ZMYND11	Q15326	602 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	OR8G1	Q15617	311 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	SGK3	Q96BR1	496 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	MDFI	Q99750	246 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	CIB1	Q99828	191 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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