RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

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Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 A0A0G2JK05 382 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 M0R135 149 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 M0R233 179 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SCO1O75880 301 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HLA-DQB1P01920 261 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 AVPR2P30518 371 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 THBS2P35442 1172 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MAP2K6P52564 334 aa6.66□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 CDC20Q12834 499 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MOB3CQ70IA8 216 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FGF11Q92914 225 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF799Q96GE5 643 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 WDFY2Q96P53 400 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 R4GMQ9 66 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR6C76A6NM76 312 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CENPBD1B2RD01 187 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 PXKQ7Z7A4 578 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FJX1Q86VR8 437 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 GALNT16Q8N428 558 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 GPHA2Q96T91 129 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PIGQQ9BRB3 760 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 POFUT1Q9H488 388 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 C5orf49A4QMS7 147 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NKX2-8O15522 239 aa6.65□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 CTAG2O75638 210 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SYNGR4O95473 234 aa6.65□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 IL13RA1P78552 427 aa6.65□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 PCOLCEQ15113 449 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR1C1Q15619 314 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RNF128Q8TEB7 428 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 GFI1Q99684 422 aa6.65□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 GPR27Q9NS67 375 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RDH8Q9NYR8 311 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PLCE1Q9P212 2302 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.65□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 LTC4SQ16873 150 aa6.65□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MISPQ8IVT2 679 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 POC1BQ8TC44 478 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RAB3CQ96E17 227 aa6.65□□□□□ -1.34
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