RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	MAP6	Q96JE9	813 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	C7orf34	Q96L11	122 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TBX15	Q96SF7	602 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ATF6B	Q99941	703 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OR52D1	Q9H346	318 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	RNF7	Q9UBF6	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GGT3P	A6NGU5	568 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		J3QW42	95 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PHYH	O14832	338 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	FCN3	O75636	299 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GADD45G	O95257	159 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SLC2A1	P11166	492 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	NOS3	P29474	1203 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SLC6A6	P31641	620 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CD200	P41217	278 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	RAD23A	P54725	363 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TPTE	P56180	551 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PSME3	P61289	254 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SPIB	Q01892	262 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OR4F5	Q8NH21	305 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0U1RQK1	487 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1B0GW55	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PRD5	423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PRF3	423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PRM7	423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		A6NLC8	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		M0R135	149 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	LGALS8	O00214	317 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OR10H3	O60404	316 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PSKH1	P11801	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF823	P16415	610 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GATA4	P43694	442 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PRKX	P51817	358 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DLX1	P56177	255 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SLC36A3	Q495N2	470 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		Q8TCH9	128 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF799	Q96GE5	643 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	WDFY2	Q96P53	400 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DUX4	Q9UBX2	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1B0GWJ7	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	P2RY10	O00398	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	MMP9	P14780	707 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CPT2	P23786	658 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CD276	Q5ZPR3	534 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SEH1L	Q96EE3	360 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	NOX4	Q9NPH5	578 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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