RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613965.1

MFGE8-216, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 5

Gene MFGE8, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-216ENST00000613965 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PGAP1Q75T13 922 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 Q8TCH9 128 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ERGIC1Q969X5 290 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MAP6Q96JE9 813 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 IFT27Q9BW83 186 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FN3KQ9H479 309 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 POM121CA8CG34 1229 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 C22orf46C9J442 243 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 M0R135 149 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR10H3O60404 316 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 HLA-DQA2P01906 255 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 NOS3P29474 1203 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PSMB10P40306 273 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 GSSP48637 474 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 RAD23AP54725 363 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TPTEP56180 551 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FGF12P61328 243 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 LCN8Q6JVE9 175 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SPATC1Q76KD6 591 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF799Q96GE5 643 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CD300LBA8K4G0 201 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 IDH3BO43837 385 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 KRT36O76013 467 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 T-ENOLP0DO92 83 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CA6P23280 308 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ANOS1P23352 680 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OMGP23515 440 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MAGEA2P43356 314 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF92Q03936 586 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TSPAN31Q12999 210 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR8G1Q15617 311 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 GPR157Q5UAW9 335 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 C16orf87Q6PH81 154 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TREML4Q6UXN2 200 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 DHFR2Q86XF0 187 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SLC22A4Q9H015 551 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SLITRK2Q9H156 845 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 RNF7Q9UBF6 113 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CTSZQ9UBR2 303 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 C5orf63A6NC05 138 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SRRM5B3KS81 715 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SFTPBP07988 381 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PSKH1P11801 424 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF823P16415 610 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PYCR1P32322 319 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 NPY4RP50391 375 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 BPIFB3P59826 476 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 LINC00471Q8N535 108 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZNRF4Q8WWF5 429 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms