RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SIAH2	O43255	324 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	XRCC2	O43543	280 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ICMT	O60725	284 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	NGF	P01138	241 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	UCP2	P55851	309 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PPP1CB	P62140	327 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ACSM1	Q08AH1	577 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	MALL	Q13021	153 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CDK5R1	Q15078	307 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ODF4	Q2M2E3	257 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	MGLL	Q99685	303 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ATE1	O95260	518 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CLPTM1	O96005	669 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TTR	P02766	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CEL	P19835	753 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	NR4A1	P22736	598 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ANOS1	P23352	680 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	KIR3DL2	P43630	455 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CCR9	P51686	369 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ERVS71-1	P61550	626 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC3A1	Q07837	685 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	DOC2B	Q14184	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	UFD1	Q92890	307 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SMIM19	Q96E16	107 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	STARD10	Q9Y365	291 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256		A6NNC1	897 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	GPRIN2	O60269	458 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	INMT	O95050	263 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	GOSR1	O95249	250 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	MUL1	Q969V5	352 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OPALIN	Q96PE5	141 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RGCC	Q9H4X1	137 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	CAD	P27708	2225 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A0U1RQV5	110 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	P2RY10	O00398	339 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OGG1	O15527	345 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	ZFPL1	O95159	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	PLAU	P00749	431 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	GLRX	P35754	106 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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