RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 UNC119BA6NIH7 251 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 CD300LBA8K4G0 201 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C3orf80F5H4A9 247 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NME4O00746 187 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GSTA4O15217 222 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A2O15244 555 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM20O43506 726 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR137BO60478 399 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV1-69P01742 117 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV4-59P01825 116 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 LCATP04180 440 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 RHCEP18577 417 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 CA6P23280 308 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC7A2P52569 658 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 PROK1P58294 105 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC23BQ15437 767 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR8B8Q15620 311 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TAF9Q16594 264 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 CGB2Q6NT52 195 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 LHX4Q969G2 390 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE2FQ969M7 185 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NMNAT3Q96T66 252 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 PKP2Q99959 881 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0U1RQK1 487 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OOEPA6NGQ2 149 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 M0R135 149 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ARPC3O15145 178 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFA2O43678 99 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GMDSO60547 372 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FCN3O75636 299 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 RENP00797 406 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GGT2P36268 569 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 IER3P46695 156 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GSK3BP49841 420 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TPTEP56180 551 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF92Q03936 586 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 RFX4Q33E94 735 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC36A3Q495N2 470 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 HDXQ7Z353 690 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FANK1Q8TC84 345 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM162AQ96A26 154 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF799Q96GE5 643 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 FUZQ9BT04 418 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52D1Q9H346 318 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DVL1O14640 695 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10H3O60404 316 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 DIRAS1O95057 198 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN15O95858 294 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 HLA-DQA2P01906 255 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GYPAP02724 150 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 NCK1P16333 377 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ANOS1P23352 680 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC6A6P31641 620 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ARF6P62330 175 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZSV7 163 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 BTN2A1Q7KYR7 527 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4K13Q8NH42 304 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52J3Q8NH60 311 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-226ENST00000593200 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms