RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.6□□□□□ -1.51
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SMAD4-212ENST00000591126 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.59□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NOX3Q9HBY0 568 aa5.59□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM38BQ9NVV0 291 aa5.59□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SPI1P17947 270 aa5.58□□□□□ -1.52
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